Bei den Gomlo-Benutzern sind die Administrator- und die Geschäftsführerberechtigung die Berechtigungen auf höchster Ebene; bis auf einige Unterschiede können diese beiden Berechtigungen alle Vorgänge ausführen.

1. Die Administratorberechtigung kann neue Betriebe oder Filialen eröffnen und alle Betriebe über das Gomlo-Konto verwalten; der Geschäftsführer hat dagegen nur Rechte in dem einen Betrieb, dem er zugewiesen ist, und keine Rechte in anderen Betrieben.

2. Das Recht, Benutzer anzulegen, hat nur der Administrator; der Geschäftsführer kann keine neuen Benutzer anlegen.

3. Der Geschäftsführer kann nicht in die Rechte des Administrators eingreifen und den Administrator-Benutzer nicht deaktivieren; der Administrator dagegen kann die Berechtigungen aller Benutzer, einschließlich der Geschäftsführer, ändern und sie deaktivieren.

4. Der Administrator kann installierte Software aus dem System löschen oder deaktivieren; der Geschäftsführer kann installierte Software nicht löschen.

5. Der Administrator kann im Kassensystem aufgenommene Bestellungen löschen; der Geschäftsführer kann sie nur ansehen und hat kein Recht, Bestellungen zu löschen.